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英文字典中文字典相关资料:


  • 在NCBI上找不到gene序列,只有蛋白序列,我应该如何正确 . . .
    ncbi没有直接给出该基因mRNA序列,不用急,跟着我一步步来。通过找到该基因在基因组的位置,减去内涵子,整理出外显子序列,就可以得到mRNA!以后碰到其他基因的类似情况,就可以这么做。第一步,找到你所用物种bsh的基因连接,在这里:
  • 如何快速查看ncbi或者ensembl上的编码基因是处于正链上 . . .
    一般来讲正链和反链这个信息数据库会给出来的,字段一般是strand。在 NCBI 或者 ensembl 数据库的查询页面上就可以查看到。题主你仔细找一找肯定能找到的。最后,如果题主想用 API 的方式查询的话,ensembl 的数据库可以用下面的代码查询:
  • 如何流畅访问NCBI网站? - 知乎
    上NCBI好慢好慢,有什么办法能流畅访问呢?2 wget curl 下载 使用 wget 或 curl 下载 SRA 数据是另一种从 NCBI 获取文件的常用方法,尤其适合需要通过脚本进行自动化下载的场景。
  • NCBI中查到的基因在哪里可以看到它的长度和cds的长度呢?
    ① 打开NCBI( https: www ncbi nlm nih gov )网页中的Nucleotide数据库,输入基因名称(以CTNNB1基因为例)。 ② 根据需要搜索,选择选择Refseq和物种。 ③ 筛选得到下列满足条件的转录本,打开第四条转录本。
  • 请问只知道一个基因的序列,如何查这个基因的基因号和功能 . . .
    登录NCBI网站,做序列对比,之后网站会输出对应的基因信息,选择相似最高的一条,进去即可看到基因号及相关信息。具体步骤如下: 登录网站NCBI(网址:National Center for Biotechnology Information) 2 选择页面右边的“Blast”模块。
  • NCBI上查找基因CDS序列没有起始密码子ATG怎么办? - 知乎
    如果在NCBI上查找的某个基因的CDS(编码序列)没有起始密码子ATG,可能是出现了以下几种情况: 1 序列不完整:可能你查找到的序列是一个不完整的CDS,导致起始或末端的密码子丢失。2 注释错误:数据库的注释可能存在错误或过时,需要进一步核实。
  • 在NCBI上如何查找含目标基因的细菌的全基因序列? - 知乎
    在 NCBI 上查找含有目标基因的细菌的全基因序列,需要结合使用 NCBI 的多个数据库和工具。以下是以 blaCTX-M 基因为例,查找含有该基因的所有大肠杆菌的全基因序列的步骤: 1 使用 Nucleotide 数据库搜索 blaCTX-M 基因序列 进入 NCBI 网站 (https: www
  • 已知蛋白氨基酸序列,怎么获取其实际核苷酸序列? - 知乎
    但是你至少能知道这个氨基酸序列是哪个物种编码的,然后在ncbi上找这个物种对应的基因组。找到基因组后,用tblastn,或者genewise,或者exonerate,把你的aa当作query,基因组做target,看aa在基因组上对到哪里。
  • 如何获取质粒载体的图谱和序列? - 知乎
    NCBI检索序列,下载gb格式文件,使用SnapGene、Vector NTI等相关软件打开即可 只要有了序列,可以直接用常用的酶切位点分析一下,自己做出图谱 发布于 2020-12-23 21:44
  • 细菌16s rRNA测序后blast比对数据库及结果应该怎么选择?
    16S rRNA基因序列比对通常是为了鉴定微生物的种类。在NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库中,有几个专门的数据库可以用来进行16S rRNA序列的比对,这些数据库包含了大量的微生物16S rRNA基因序列,用于帮助研究者识别未知的微生物。





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